Святыни обители:

- мощи Преподобного Иова Почаевского  ; 

- мощи Преподобного Амфилохия  Почаевского  .

С возвращением Почаевской обители в лоно православия для всеобщего почитания были вновь открыты мощи преподобного Иова; десятилетие спустя их переложили в новую серебряную раку, представляющую собой настоящее произведение искусства: на верхней доске вычеканено изображение усопшего преподобного Иова в мантии и схиме, а по сторонам — Матерь Божия в облаках с преподобным Иовом пред Нею и вид Свято-Троицкой церкви (над которой было явление во время турецкого нашествия, а также явление Божией Матери в столпе огненном).

Балдахин над мощами преподобного, привезенный из Италии (итальянец Леопольд Менционе изготовил его из белого каррарского мрамора), появился в 1889 году. По форме это сень, поддерживаемая четырьмя витыми колоннами. Каждая из пяти досок, вместе составляющих потолок, выполнена в форме полукруга; на венчающей потолок центральной части — рельефное изображение Святого Духа в виде голубя, окруженного сиянием.



Все это великолепие находится в простом природном гроте, где иконы и каррарский мрамор соседствуют с грубой и невзрачной горной породой, нависающей темно-серыми сводами, — ее-то и видел преподобный Иов, удаляясь сюда для уединенной молитвы.

Сама пещера находится тут же, рядом, ее тоже можно посетить, став на несколько минут свидетелем подвигов святого, его небесной славы, символически воплощенной в роскошном убранстве балдахина, и скудости земной жизни.Церковь преподобного Иова весьма велика, грот составляет лишь малую ее часть; внутри она необычно вытянута и напоминает этим длинную галерею. Расположена церковь на южной окраине Почаевской горы, на месте старинного кладбища, и тянется вдоль всего южного склона. Вход в пещеру — в центре храма.

Построена была эта церковь стараниями Николая Потоцкого и первоначально освящена во имя великомученицы Варвары. В 1864 году ее переосвятили — во имя преподобного Иова. Именно эту церковь обычно называют Пещерной, памятуя о том месте, где проходили земные подвиги преподобного.